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PacBio全长转录组

近年来,随着NGS测序技术的发展,转录组测序已经成为研究基因表达调控的主要手段。通过转录组测序可挖掘基因功能、基因表达及调控模式,揭示表型背后的分子生物学机制,已经广泛应用于与基础研究、临床诊断及药物研发等领域。但由于NGS测序平台受到读长的限制(PE150),在转录本组装的过程中存在较多的嵌合体,无法得到完整的转录本信息,进而影响基因融合、表达差异、可变剪接等分析结果的准确性。PacBio测序平台基于第三代单分子实时测序的技术原理,最大优势之一即读长较长,可达到 10-40Kb,该长度已超过一般转录组中典型的基因长度,所以利用第三代 PacBio测序平台进行转录组的研究,可以得到全长转录本信息,无需组装,保证了转录组测序结果的准确性。

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1 PacBio全长转录组分析流程

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