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16S/18S/ITS扩增子测序

16SrDNA是细菌分类学研究中最常用的“分子钟”,其序列包含9个可变区(Variableregion)和10个保守区(constantregion)。可变区因细菌而异,且变异程度与细菌的系统发育密切相关。通过检测16SrDNA的序列变异和丰度,可以了解环境样品中群落多样性信息。基于16SrDNA的分析在微生物分类鉴定,微生态研究等方面起到重要作用。 

18SrDNA或ITS(InternalTranscribedSpacer)被广泛应用在真菌分类鉴定中。18SrDNA在系统发育研究中较适用于种级以上阶元的分类。ITS属于中度保守区域,利用它可研究种及种以下的分类阶元。

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